Tak orzekł Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku o sygnaturze I FSK 1367/11 z 4 lipca 2012 roku.
Sytuacja podatnika
Na wokandę Naczelnego Sądu Administracyjnego trafiła sprawa Spółki, która zakupiła w Niemczech samochody używane. Podatnik niemiecki omyłkowo zaniedbał skreślenia widocznej na wystawionych rachunkach informacji "opodatkowanie w systemie VAT marża". Na podstawie przedstawionych przez Spółkę danych, organ podatkowy wydał zaświadczenie VAT-25 o braku obowiązku uiszczenia podatku z tytułu przywozu nabywanych z terytorium państwa członkowskiego innego niż terytorium kraju pojazdów, które mają być dopuszczone do ruchu.
Następnie, w wyniku przeprowadzonej kontroli, organ podatkowy ustalił, że transakcje nabycia pojazdów zostały w Niemczech opodatkowane na zasadach ogólnych: podatnik niemiecki nabył samochody używane bez podatku VAT, zrezygnował z zastosowania opodatkowania w systemie VAT marża i dokonał ich dostawy na rzecz Spółki jako wewnątrzwspólnotowej dostawy towarów, w deklaracji rocznej zgłosił sprzedaż jako WDT i takie też dane podał w informacji podsumowującej, na fakturach sprzedaży wpisując numer VAT Spółki. W konsekwencji, organ podatkowy uznał, że faktury VAT powinny zostać ujęte w rejestrze wewnątrzwspólnotowych nabyć towarów oraz w rejestrze zakupów w kwotach wynikających z przeliczenia kwoty zakupu wg kursu EUR z dnia wystawienia faktury oraz z uwzględnieniem wysokości podatku naliczonego VAT wg stawki 22% i wydał decyzje określające podatnikowi zobowiązanie podatkowe w kwocie odmiennej od zadeklarowanej.
Spółka nie zgodziła się z powyższą decyzją, żądając wyjaśnienia dlaczego organ podatkowy wydając zaświadczenia VAT–25 uznał, ze załączone do wniosków o jego wydanie dokumenty (faktury) wskazywały, że nie zachodziło w tym przypadku węwnątrzwspólnotowe nabycie towarów, a w postępowaniu podatkowym już te same faktury nie wskazywały tego jednoznacznie, a wręcz przeciwnie wskazywały zdaniem organu na sytuację odwrotną.
Wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego
W uzasadnieniu wyroku NSA zwrócił uwagę na fakt, że Spółka, wnosząc o wydanie zaświadczenia VAT-25 załączyła te same faktury, które przedstawiła potem organowi w trakcie postępowania podatkowego. Sąd zgodził się z pełnomocnikiem Spółki, iż trudno uznać, że dokonanie prawidłowej oceny przez organ podatkowy przy wydawaniu zaświadczenia czy zapis na fakturze w sposób jednoznaczny wskazuje, że nie mamy do czynienia z wewnątrzwspólnotowym nabyciem było nadmiernie zawiłe i niemożliwe do określenia w sposób prawidłowy. Przepisy Ordynacji podatkowej umożliwiają bowiem organowi wydającemu zaświadczenie przeprowadzenie postępowania wyjaśniającego. Zgodnie z art.306a Ordynacji podatkowej organ podatkowy jest obowiązany wydać zaświadczenie, jeżeli chodzi o potwierdzenie faktów albo stanu prawnego, wynikających z prowadzonej przez ten organ ewidencji, rejestrów lub z innych danych znajdujących się w jego posiadaniu. Organ podatkowy, przed wydaniem zaświadczenia, może więc przeprowadzić w niezbędnym zakresie postępowanie wyjaśniające. Stosownie do art.306c Ordynacji organ może odmówić wydania zaświadczenia.
Natomiast w rozpoznawanej sprawie nie ulega najmniejszej wątpliwości, że organ podatkowy I instancji wydając zaświadczenie VAT-25 uznał, że przedstawione przez skarżącą dokumenty w sposób jednoznaczny wskazują, że nie zachodziło w tym przypadku wewnątrzwspólnotowe nabycie towarów, bo gdyby tak nie było organ odmówiłby wydania zaświadczenia.
NSA zgodził się z poglądem, że wydane przez organ podatkowy zaświadczenie VAT-25 jest zaświadczeniem uprawniającym, albowiem wywołuje skutki w sferze prawnej podmiotów podatkowych. W takim zaś przypadku zaświadczeniu organu wydanemu podatnikowi podatku od towarów i usług o braku obowiązku uiszczenia podatku VAT należałoby przypisać takie same skutki jakie wywołuje wydana na podstawie przepisów Ordynacji podatkowej interpretacja indywidualna.
Zważywszy, że w rozpoznawanej sprawie podatnik działał zgodnie z zasadą zaufania do organów podatkowych nie można z tego powodu stawiać mu zarzutów naruszenia przepisów ustawy o VAT i kwestionować deklarowanych, ze względu na treść wydanych przez organ podatkowy zaświadczeń, kwot podatku VAT do zapłaty.
Podstawa prawna: art.306a – 306c ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 roku – Ordynacja podatkowa.
